Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMCD1Q9NZU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMCD1Q9NZU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMCD1Q9NZU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms