Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRP1BQ9NZR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRP1BQ9NZR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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