Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLGN3Q9NZ94 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms