Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA3Q9NZ52 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGA3Q9NZ52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGA3Q9NZ52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms