Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms