Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNA2D2Q9NY47 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA2D2Q9NY47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms