Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK13-1Q9NX77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms