Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf42Q9NWW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf42Q9NWW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms