Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN6Q9NWW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN6Q9NWW5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN6Q9NWW5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLN6Q9NWW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLN6Q9NWW5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms