Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PANK4Q9NVE7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms