Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCF3Q9NUQ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF3Q9NUQ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms