Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD18Q9NS91 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD18Q9NS91 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD18Q9NS91 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms