Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRIP3Q9NQ35 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms