Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ASCL3Q9NQ33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASCL3Q9NQ33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms