Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRC4Q9NPP4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms