Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XAB2Q9HCS7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms