Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMURF2Q9HAU4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms