Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1BQ9H9Y6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR1BQ9H9Y6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR1BQ9H9Y6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms