Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MVB12BQ9H7P6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVB12BQ9H7P6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms