Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A3Q9H7F0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms