Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMYD3Q9H7B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMYD3Q9H7B4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms