Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TAF1DQ9H5J8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TAF1DQ9H5J8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TAF1DQ9H5J8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms