Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRN3Q9H3W5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRN3Q9H3W5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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