Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB17Q9H0T7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB17Q9H0T7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms