Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF541Q9H0D2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF541Q9H0D2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF541Q9H0D2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF541Q9H0D2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms