Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NBPF3Q9H094 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NBPF3Q9H094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms