Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTDSP1Q9GZU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSP1Q9GZU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms