Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZYG11BQ9C0D3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZYG11BQ9C0D3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms