Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AMBRA1Q9C0C7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMBRA1Q9C0C7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms