Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZCCHC2Q9C0B9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZCCHC2Q9C0B9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZCCHC2Q9C0B9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms