Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM9Q9C026 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM9Q9C026 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms