Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV8

CEP41, Centrosomal protein of 41 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41Q9BYV8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP41Q9BYV8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP41Q9BYV8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms