Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RBCK1Q9BYM8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBCK1Q9BYM8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms