Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL1Q9BYD6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL1Q9BYD6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL1Q9BYD6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL1Q9BYD6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms