Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FANCD2Q9BXW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
FANCD2Q9BXW9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FANCD2Q9BXW9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms