Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SALL3Q9BXA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms