Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf43Q9BWL3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf43Q9BWL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms