Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM62Q9BVG3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM62Q9BVG3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM62Q9BVG3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms