Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf50Q9BV19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf50Q9BV19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms