Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN3Q9BTN0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms