Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM175Q9BSA9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM175Q9BSA9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM175Q9BSA9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms