Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SDF4Q9BRK5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SDF4Q9BRK5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SDF4Q9BRK5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms