Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM1Q9BR11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZSWIM1Q9BR11 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms