Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A3Q99624 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A3Q99624 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms