Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LGMNQ99538 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LGMNQ99538 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGMNQ99538 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms