Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RSF1Q96T23 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RSF1Q96T23 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RSF1Q96T23 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
RSF1Q96T23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
RSF1Q96T23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms