Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT8L2Q96SF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCT8L2Q96SF2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCT8L2Q96SF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms