Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF488Q96MN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF488Q96MN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms