Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM20AQ96MK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM20AQ96MK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM20AQ96MK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms