Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNPC3Q96LT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNPC3Q96LT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms